Qué saber
- Un archivo FNA es un archivo de alineación de secuencias de proteínas y ADN en formato FASTA.
- Abre uno con Geneious.
- Convierta a FASTA y formatos similares con el mismo programa.
Este artículo explica qué es un archivo FNA, cómo abrir uno y cómo guardar uno en un formato diferente como FASTA, GB, VCF, imágenes, etc.
¿Qué es un archivo FNA?
Un archivo con la extensión de archivo FNA es un archivo de alineación de secuencias de proteínas y ADN en formato FASTA que almacena información de ADN que puede ser utilizada por software de biología molecular.
Los archivos FNA, específicamente, pueden usarse para contener solo información de ácido nucleico, mientras que otros formatos FASTA contienen otra información relacionada con el ADN, como aquellos con FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET o extensiones de archivo AA.
Estos formatos FASTA basados en texto surgieron originalmente de un paquete de software con el mismo nombre, pero ahora se utilizan como estándar en aplicaciones de alineación de secuencias de ADN y proteínas.
FNA también hace referencia a algunos términos tecnológicos que no tienen nada que ver con este formato de archivo, como la aceptación final de la red, la función de aumento de atributos/nombres de archivo, la arquitectura de red de Fujitsu y la publicidad de vecinos rápidos.
Cómo abrir un archivo FNA
Abra uno en Windows, macOS y Linux con Geneious (es gratis durante 14 días). Para hacer esto, vaya al menú File > Import y elija importar el archivo a través de From Fileelemento del menú.
También puede abrir uno con BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Pruebe Notepad++ u otro editor de texto si esas ideas no funcionan. De hecho, el archivo puede estar basado en texto y ser fácil de leer, o puede descubrir que no tiene nada que ver con el formato FASTA, en cuyo caso abrir el archivo como un documento de texto puede revelar texto que identifica lo que se usó para crear el archivo. o en qué formato está el archivo.
Cómo convertir un archivo FNA
No podemos verificar esto porque no lo hemos probado, pero debería poder usar Geneious para convertir el archivo a muchos otros formatos, como FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV y VCF. Esto se puede hacer a través del menú File > Export del programa.
Ese mismo programa también debería poder guardar el archivo en PNG, JPG, EPS o PDF, a través de Archivo > Guardar como archivo de imagen.
Aunque normalmente no puede simplemente cambiar el nombre de la extensión de un archivo a otra cosa y esperar que funcione de la misma manera, puede cambiar el nombre de un archivo. FNA a un archivo. FA si su software de secuenciación de ADN particular solo reconoce el formato FA.
En lugar de cambiar el nombre de las extensiones de archivo, querrá usar un convertidor de archivos gratuito para convertir otros tipos de archivos. En el caso de los archivos FNA y FA, sucede que algunos programas solo abren archivos que tienen la extensión de archivo FA, en cuyo caso, cambiar el nombre debería funcionar bien.
¿Sigue sin poder abrirlo?
Si después de usar los programas de arriba, aún no puede abrir su archivo, es posible que la extensión del archivo en realidad no lea. FNA, sino algo que se ve similar.
Por ejemplo, los archivos FNG (Font Navigator Group) se parecen mucho a que dicen ". FNA", pero si miras de cerca, solo las dos primeras letras son iguales. Dado que las extensiones de archivo son diferentes, es una indicación de que tienen un formato de archivo diferente y lo más probable es que no funcionen con los mismos programas.
Lo mismo podría decirse de muchas otras extensiones de archivo como FAX, FAS (AutoLISP compilado de carga rápida), FAT, FNTA (Fuente Aleph One), FNC (Funciones Vue) y FND (Búsqueda guardada de Windows).
La idea aquí es asegurarse de que la extensión del archivo sea. FNA. Si es así, intente nuevamente usar los programas de arriba para abrirlo o convertirlo. Si tiene un tipo de archivo diferente, investigue su extensión para averiguar qué aplicaciones se necesitan para abrirlo o convertirlo.
Preguntas Frecuentes
¿Cómo se abre un archivo FNA en Python?
Primero, convierta el archivo FNA al formato FASTA usando una aplicación de terceros como Geneious. Luego, puede descargar Biopython, un conjunto de herramientas disponibles gratuitamente para el cálculo biológico para el trabajo en bioinformática. Finalmente, consulte el Tutorial y libro de cocina de Biopython para obtener instrucciones sobre cómo trabajar con archivos FASTA.
¿Cómo encuentro mis números de fabricante de FNA en un archivo sin procesar de Ancestry?
Puede descargar la mayoría de los datos de ADN de Ancestry.com en formato.txt. Sin embargo, solo los clientes cuyo ADN se analizó con secuenciación de próxima generación (NGS) tienen la opción de descargar un archivo VCF. Para descargar un archivo VCF, debe ser el propietario del ADN, someterse a una prueba de ADN con tecnología NGS y tener al menos 350 MB de espacio disponible en su dispositivo.
